Des échantillons d’eaux usées révèlent des niveaux record de Covid-19 aux États-Unis

Avec les tests Covid-19 à domicile très demandés et leur efficacité remise en question, les services de santé de la Californie au Massachusetts se tournent vers des échantillons d’eaux usées pour avoir une meilleure idée de l’ampleur de la propagation du coronavirus dans les communautés et de ce qui pourrait être en réserve pour la santé systèmes de soins.

Les experts affirment que les eaux usées sont la clé pour mieux comprendre la santé publique des villes et des quartiers, en particulier dans les zones mal desservies qui n’ont pas un accès égal aux soins.

« Chaque fois qu’une personne infectée utilise les toilettes, elle jette cette information dans les toilettes, où elle est collectée, agrégée et mélangée au caca de milliers d’autres personnes », a déclaré Newsha Ghaeli, co-fondatrice et présidente de Biobot Analytics. , une société d’épidémiologie des eaux usées basée dans le Massachusetts.

« Même si vous ne pouvez pas accéder à un test, vous faites toujours caca », a déclaré Ghaeli. « Cela ne dépend pas de votre accès à des soins de santé ou à une assurance maladie. »

La surveillance des eaux usées peut également mesurer d’autres problèmes de santé publique, tels que l’obésité, les opioïdes et même la polio, a déclaré Sheree Pagsuyoin, professeur agrégé de génie civil et environnemental à l’Université du Massachusetts Lowell. La pandémie a inauguré une nouvelle ère d’analyse des eaux usées, autrefois une discipline décriée, pour éclairer les politiques de santé publique.

« C’est un peu comme cartographier une tendance », a déclaré Pagsuyoin, ajoutant qu’il y a eu un « changement de paradigme » alors que de plus en plus de villes se tournent vers l’analyse des eaux usées pour mieux comprendre les défis locaux.

Une analyse récente des eaux usées provenant de diverses sources à travers le pays indique une augmentation sans précédent des infections à un moment où des millions de personnes sont obligées de reconsidérer leurs projets de voyage et de vacances.

Selon le tableau de bord des eaux usées de Biobot Analytic, les niveaux de Covid-19 détectés dans les échantillons d’eaux usées à travers le pays sont plus élevés maintenant qu’à tout autre moment de la pandémie.

Des échantillons récents d’eaux usées à Houston, par exemple, montrent qu’il y a eu une forte augmentation de la quantité de coronavirus détectée dans les eaux usées de la ville. Au 20 décembre, la charge virale de Houston, ou la quantité de virus trouvée dans les échantillons, était de 546% et le taux de positivité était de 14%, selon le tableau de bord des eaux usées du département de la santé de la ville. La charge virale est en hausse par rapport à 142% la semaine dernière et 76% la semaine précédente.

Plus de 700 employés de la ville ont contracté le virus, maire Sylvester Turner dit sur Twitter. En conséquence, Turner a annoncé l’ouverture de deux mégasites supplémentaires qui offriront des tests gratuits aux résidents.

Le Dr Amesh Adalja, chercheur principal au Johns Hopkins Center for Health Security, a déclaré : « Les eaux usées vont être un indicateur avancé de ce qui se passe dans une communauté donnée.

« Cela donnera également une indication de ce qui va arriver, car tous les cas de Covid ne sont pas examinés en clinique – de nombreux cas sont bénins ou asymptotiques », a-t-il ajouté. « Mais le fait est que les personnes infectées vont excréter le virus dans leurs selles. »

La surveillance des eaux usées montre également que le nombre de cas augmente dans certaines parties de la Californie, du Colorado, de l’Idaho, du Massachusetts, du Missouri et de la Caroline du Nord, ainsi qu’au Canada, en Espagne et au Royaume-Uni.

Une équipe de chercheurs de l’Université du Missouri a travaillé avec le ministère de la Santé et des Services aux personnes âgées et le ministère des Ressources naturelles pour suivre le virus dans les eaux usées.

Des chercheurs du Missouri séparent le virus des plus grosses particules de déchets et extraient son matériel génétique. Ils peuvent également amplifier le matériel génétique et l’étudier plus en détail grâce à un processus connu sous le nom de réaction en chaîne par polymérase de transcription inverse quantitative. En plus de détecter la présence du virus à l’origine du Covid-19 dans les déchets humains, les chercheurs sont également capables d’identifier des variantes spécifiques.

De nouvelles données montrent que la variante hautement contagieuse de l’omicron se propage rapidement dans tout l’État.

Des tests approfondis menés le 20 décembre ont révélé des mutations associées à la variante omicron dans 32 des 57 échantillons d’eaux usées collectés dans tout l’État, a déclaré à l’Associated Press Jeff Wenzel, qui supervise le programme de surveillance des eaux usées pour le département de la santé de l’État. Les tests effectués la semaine précédente ont trouvé la mutation dans 15 des 63 sites de test.

Pagsuyoin fait partie d’une équipe du Massachusetts développant un capteur sans fil qui pourrait détecter le SRAS-CoV-2, le virus qui cause le Covid-19, dans l’air et dans les eaux usées quelques jours avant qu’une épidémie ne se produise. Les chercheurs entreprendront une étude de trois ans en utilisant les données de trois sites de surveillance, deux d’entre eux dans le Massachusetts et l’autre aux Philippines.

« Les gens deviennent un peu plus ouverts à l’utilisation des données sur les eaux usées pour savoir d’où une maladie est censée sortir », a-t-elle déclaré. « Nous pouvons utiliser cette technologie pour surveiller plus efficacement la santé de la population. »

L’analyse des eaux usées est plus efficace comme signal d’alerte précoce entre les surtensions – en particulier parce que les gens ne testent pas aussi souvent lorsque les taux sont en baisse – et dans le suivi des cas où les vagues commencent à se dissiper. Cela peut également aider à combler certaines lacunes pendant les vagues lorsque les tests sont insuffisants et servir de moyen de comparer les vagues, a déclaré le Dr Albert Ko, professeur de santé publique, d’épidémiologie et de médecine à l’École de santé publique de l’Université de Yale.

« Ce qui est utile, c’est d’examiner les tendances au fil du temps et de comparer, disons: » Sommes-nous aussi mauvais dans la transmission de cette vague par rapport à la précédente ? » de telles comparaisons.

Ko a déclaré que la surveillance des eaux usées est mieux utilisée dans le cadre d’une analyse plus large d’une épidémie qui prend en compte d’autres points de données, comme les tests.