Enquête sérologique à grande échelle sur le SRAS-CoV-2 chez plusieurs espèces de rongeurs à travers l’Europe

Dans une étude récente publiée dans le bioRxiv* serveur de prétirage, les scientifiques ont mené une sérosurveillance du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) chez des rongeurs sauvages à travers l’Europe.

Arrière plan

La transmission inverse de maladies zoonotiques de plusieurs agents pathogènes (virus, bactéries, champignons et parasites eucaryotes) de l’homme à l’animal est connue depuis longtemps et établie à l’échelle mondiale comme une préoccupation capitale. Une population animale affectée par de tels agents pathogènes humains peut servir de réservoir pour la réinfection humaine, entravant ou entravant l’élimination de l’agent pathogène. Les agents pathogènes sensibles aux mutations, comme les virus à acide ribonucléique (ARN), pourraient acquérir de nouvelles mutations en circulant parmi de nouveaux hôtes animaux. Ils peuvent également présenter une capacité d’impacts imprévus sur l’épidémiologie humaine.

Il existe un besoin immédiat de concevoir des cadres pour évaluer le risque de SRAS-CoV-2 dans les populations de mammifères sauvages compte tenu du contexte de la pandémie de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) et du point de vue d’une seule santé. Dans une déclaration conjointe publiée le 7 mars 2022, l’Office international des épizooties (OIE), l’Organisation des Nations Unies pour l’alimentation et l’agriculture (FAO) et l’Organisation mondiale de la santé (OMS) ont souligné l’importance du suivi des mammifères sauvages pour l’infection par le SRAS-CoV-2. La déclaration a également encouragé l’échantillonnage d’animaux sauvages reconnus comme potentiellement vulnérables au SRAS-CoV-2, tels que les rongeurs.

Le 6 décembre 2021, le groupe consultatif FAO-OIE sur l’évolution du SRAS-CoV-2 chez les animaux a déclaré qu’une lacune importante dans l’enquête sur le SRAS-CoV-2 était l’absence d’une analyse de surveillance importante des populations de rongeurs exposées à l’interaction humaine. Compte tenu de la grande biodiversité et de la présence généralisée de rongeurs, il est nécessaire de mener des recherches de surveillance plus approfondies dans divers habitats, continents et espèces de rongeurs non commensaux.

À propos de l’étude

Dans le présent travail, les chercheurs ont effectué une évaluation sérologique approfondie du SRAS-CoV-2 chez plusieurs espèces de rongeurs à travers l’Europe pour donner un aperçu de l’établissement et de la transmission potentiels du SRAS-CoV-2 chez les rongeurs sauvages dans diverses situations. Ils ont mené des enquêtes dans les parcs urbains (tels que les zoos), où il existe un fort potentiel de transmission de l’homme aux rongeurs, et dans les forêts, car le SRAS-CoV-2 a naturellement infecté divers mammifères forestiers sauvages.

En 2021, l’équipe a échantillonné 1 202 rongeurs et 35 soricidae (Crocidura et Sorex) dans 23 zones forestières et huit parcs urbains dans cinq pays européens (Belgique, Irlande, France, Pologne et Allemagne). En outre, le statut sérologique du SRAS-CoV-2 de tous les sujets a été déterminé par une analyse par immunofluorescence (IF) basée sur des cellules infectées.

Résultats

Collectivement, les résultats de l’étude ont montré que tous les échantillons analysés sauf un avaient un statut séronégatif pour le SRAS-CoV-2. L’équipe a testé le seul animal présumé positif deux fois par IF et l’a trouvé incontestablement positif les deux fois. L’animal était une souris des bois, c’est-à-dire Apodemus sylvaticus, échantillonné le 6 avril 2021 dans un parc de la ville près d’Anvers, en Belgique. Les tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR) spécifiques au SRAS-CoV-2 effectués sur des échantillons des 59 animaux de cet endroit pour explorer plus avant la circulation possible du virus dans la région ont démontré que toutes les PCR étaient négatives, y compris celles de l’animal séropositif. Ce phénomène pouvait être attendu, compte tenu de la brève durée d’excrétion du virus précédemment documentée chez les rongeurs.

conclusion

L’étude actuelle rapporte la surveillance sérologique de l’exposition au SRAS-CoV-2 chez 1 237 rongeurs sauvages et plusieurs petits mammifères à travers l’Europe. Les chercheurs ont noté que parmi les échantillons évalués, un seul était séropositif pour le SRAS-CoV-2.

Le 6 juillet 2022, l’OIE a présenté un scénario potentiellement effrayant : alors que les épidémies sporadiques de COVID-19 dans le zoo ou les animaux domestiques ont peu d’impact à long terme, les infections dans les populations d’animaux sauvages augmentent la possibilité que le virus évolue davantage chez les animaux et se réintroduise éventuellement. dans les humains à l’avenir. L’organisation a également réitéré que ce n’est qu’en suivant la propagation du virus que l’image globale de la santé animale et humaine pourrait être pleinement comprise et prédire et arrêter avec précision les futures épidémies.

Dans l’ensemble, la présente enquête a démontré que, d’avril à septembre 2021, le SRAS-CoV-2 ne s’est pas propagé de manière significative parmi les rongeurs sauvages d’Europe du Nord. Néanmoins, l’équipe a noté que la circulation actuelle de nouvelles variantes du SARS-CoV-2 chez l’homme avec des propriétés potentiellement tropiques pour les rongeurs était un avertissement fort de la possibilité de réservoirs du SARS-CoV-2 chez les rongeurs sauvages. Par conséquent, la poursuite de la surveillance du SRAS-CoV-2 chez les rongeurs sauvages est nécessaire.

*Avis important

bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.