TGen et Deepcell collaborent pour utiliser une technologie basée sur l’IA pour classer et isoler les cellules malades

Le Translational Genomics Research Institute (TGen), une filiale de City of Hope, s’associe à une entreprise de la Silicon Valley pour devenir l’un des premiers instituts de recherche au monde à utiliser une nouvelle technologie d’imagerie et de tri basée sur l’intelligence artificielle pour classer et isoler cellules malades individuelles.

L’équipe de recherche sur l’évaluation des technologies scientifiques (START) de TGen s’associe à Deepcell, basé à Menlo Park, qui a développé une nouvelle plate-forme d’imagerie qui utilise l’IA pour analyser des cellules vivantes individuelles en temps réel.

TGen est la première d’une poignée d’institutions à rejoindre le programme d’accès à la technologie de Deepcell.

La technologie utilise l’imagerie cellulaire et l’IA pour analyser la morphologie d’une seule cellule – ; essentiellement à quoi ça ressemble -; dans le contexte des autres cellules de l’échantillon. Cela permet aux utilisateurs qui recherchent de nouvelles façons de comprendre la biologie cellulaire pour caractériser et isoler les cellules à partir de caractéristiques visuelles minuscules. Sa résolution est suffisamment puissante pour voir de nombreux composants de chaque cellule, y compris le noyau de la cellule, qui contient son ADN et d’autres informations génomiques.

La technologie de Deepcell permettra à nos chercheurs TGen de se concentrer sur les parties les plus critiques d’une cellule pour mieux comprendre ce qui est à l’origine de la maladie », a déclaré

Stephanie Pond, Ph.D., TGen Vice-présidente des technologies émergentes et responsable de START

Premier foyer : le mélanome

Alors que la technologie de Deepcell peut être utilisée dans l’évaluation de n’importe quelle maladie, le partenariat TGen-Deepcell débutera par une étude pilote pour caractériser le mélanome, l’un des types de cancer de la peau les plus dangereux. Deepcell a précédemment annoncé un partenariat pour étudier le mélanome avec l’Université de Zurich, en Suisse, l’une des rares institutions dans le monde, avec TGen, à avoir accès à la technologie de Deepcell.

Le Dr Jeffrey Trent, président et directeur de la recherche de TGen, dirige les efforts scientifiques de TGen sur le mélanome. Ce partenariat bénéficie de décennies de recherche génomique et de modèles cellulaires de mélanomes pré-malignes et hautement métastatiques.

« Les avancées majeures en médecine proviennent de l’introduction d’outils plus pointus et de méthodes de pointe qui peuvent ouvrir de nouvelles voies de recherche », a déclaré le Dr Trent. « La technologie de Deepcell nous ouvre sans aucun doute de nouvelles voies à explorer. »

Deepcell fournit une analyse avancée

« Notre technologie unique alimentée par l’IA transforme la morphologie cellulaire en un marqueur quantitatif à haut débit à utiliser dans la recherche », a déclaré Maddison Masaeli, co-fondateur et PDG de Deepcell. « Grâce à notre technologie, les scientifiques peuvent désormais caractériser, identifier et isoler des cellules viables sans étiquette, et utiliser les marqueurs de haute dimension dérivés de l’IA et les cellules triées pour compléter les flux de travail moléculaires existants ainsi qu’une nouvelle méthode autonome.

Le Dr Pond a déclaré que, parce que le tri Deepcell garde les cellules intactes, il fonctionnera main dans la main avec la technologie de séquençage unicellulaire établie de TGen pour fournir la meilleure compréhension possible de la façon dont chaque cellule pourrait contribuer à la maladie, en particulier les cancers.

« La compréhension d’une image complète du microenvironnement tumoral devrait fournir des indices sur la meilleure façon de traiter chaque patient, en se concentrant particulièrement sur le type de cellules immunitaires qui pourraient être présentes et coexister avec des cellules cancéreuses », a déclaré le Dr Pond.

Le nouveau programme START de TGen

Le programme START de TGen est un nouveau centre d’évaluation des technologies, dédié à l’évaluation des technologies précommerciales à utiliser dans les programmes de recherche de TGen. TGen excelle dans l’application des nouvelles technologies aux problèmes cliniques les plus épineux. Au cours de la dernière décennie, par exemple, TGen a reçu le premier accès au monde à de multiples technologies qui transforment le domaine de la génomique. Celles-ci incluent : le séquençage rapide du génome entier, le balayage immunologique PepSeq (protéine), le séquençage unicellulaire et l’édition du génome CRISPR à haut débit.

START explore, embarque, teste, puis transmet les nouvelles technologies à TGen et à la grande entreprise City of Hope. Ce processus apporte de nouvelles technologies qui alimentent des programmes de recherche innovants, qui à leur tour alimentent de nouveaux efforts de commercialisation de TGen.