Le COVID est en plein essor dans le pays le plus vacciné au monde

Le petit archipel des Seychelles, au nord-est de Madagascar dans l’océan Indien, est devenu le pays le plus vacciné au monde contre le COVID-19.

Environ 71% des personnes ont reçu au moins une dose d’un vaccin COVID et 62% ont été entièrement vaccinées. Parmi ceux-ci, 57% ont reçu le vaccin Sinopharm et 43% AstraZeneca.

Malgré cela, il y a eu une augmentation récente des cas, 37% des nouveaux cas actifs et 20% des cas hospitaliers étant entièrement vaccinés. Le pays a dû réimposer certaines restrictions.

Comment cela peut-il arriver? Il y a plusieurs explications possibles:

1. le seuil d’immunité du troupeau n’a pas été atteint – une vaccination à 62% n’est probablement pas adéquate avec les vaccins utilisés

2. l’immunité collective est inaccessible en raison de l’efficacité insuffisante des deux vaccins utilisés

3. les variantes qui échappent à la protection vaccinale dominent aux Seychelles

4. la variante indienne B1617 se propage, ce qui semble être plus infectieux que les autres variantes

5. des défaillances massives de la logistique de la chaîne du froid nécessaire au transport et au stockage, qui ont rendu les vaccins inefficaces.

Que nous apprend l’expérience du pays sur les variantes, l’efficacité des vaccins et l’immunité collective?

Décomposons cela.

Les variantes peuvent échapper à la protection vaccinale

Il y a des rapports de la variante sud-africaine B.1.351 circulant aux Seychelles. Cette variante montre la plus grande capacité à échapper à la protection vaccinale de toutes les variantes COVID à ce jour.

En Afrique du Sud, une étude a montré qu’AstraZeneca avait une efficacité de 0 à 10% contre cette variante, ce qui a incité le gouvernement sud-africain à cesser d’utiliser ce vaccin en février.

L’efficacité du vaccin Sinopharm contre cette variante est inconnue, mais des études en laboratoire montrent une certaine réduction de la protection, sur la base de tests sanguins, mais probablement une certaine protection.

Cependant, aucune surveillance complète n’existe dans le pays pour savoir quelle proportion de cas est due à la variante sud-africaine.

La variante britannique B117, qui est plus contagieuse que la souche d’origine, est devenue la variante dominante aux États-Unis. Mais les États-Unis ont quand même réussi à réduire considérablement les cas de COVID-19 grâce à la vaccination, la plupart des personnes recevant les vaccins Pfizer et Moderna.

Israël, où la variante britannique était dominante, a également un taux de vaccination très élevé, ayant vacciné près de 60% de sa population avec Pfizer. Il a révélé une efficacité de 92% contre toute infection, y compris une infection asymptomatique, et Israël a constaté une forte baisse des nouveaux cas.

Le Royaume-Uni a utilisé une combinaison de vaccins Pfizer et AstraZeneca. Plus de 50% de la population a reçu une dose unique et près de 30% sont entièrement vaccinés. Le pays a également connu une baisse significative du nombre de cas.

Mais il y a une flambée actuelle de cas dans le nord-ouest de l’Angleterre, la plupart des nouveaux cas dans la ville de Bolton étant la variante indienne. Cette variante provoque également des épidémies à Singapour, qui avait auparavant bien contrôlé le virus.

Les Seychelles doivent effectuer d’urgence un séquençage et une surveillance du génome pour voir quelle contribution les variantes préoccupantes apportent et si la variante indienne est présente.

Si la variante sud-africaine est dominante, le pays doit utiliser un vaccin qui fonctionne bien contre elle. De nombreuses entreprises fabriquent des boosters ciblés sur cette variante, mais pour l’instant, Pfizer serait une option. Au Qatar, des chercheurs locaux ont découvert que Pfizer avait une efficacité de 75% contre la variante sud-africaine.

Nous devons utiliser des vaccins à haute efficacité pour obtenir une immunité collective

L’efficacité rapportée de Sinopharm est de 79% et AstraZeneca est de 62 à 70% à partir des essais cliniques de phase 3.

Nos recherches au Kirby Institute ont montré qu’en Nouvelle-Galles du Sud, en Australie, l’utilisation d’un vaccin avec une efficacité de 90% contre toutes les infections signifie que l’immunité du troupeau pourrait être obtenue si 66% de la population était vaccinée.

Cependant, l’utilisation de vaccins moins efficaces signifie que davantage de personnes doivent être vaccinées. Si le vaccin est efficace à 60%, la proportion à vacciner s’élève à 100%.

Lorsque vous obtenez une efficacité inférieure à 60%, l’immunité collective n’est pas réalisable.

Cependant, ces calculs ont été effectués pour le COVID-19 régulier causé par la variante D614G qui a dominé en 2020. Il a un indice de reproduction (R0) de 2,5, ce qui signifie que les personnes infectées par le virus en infectent en moyenne 2,5 autres.

Mais la variante B117 est 43-90% plus contagieuse que D614G, donc le R0 peut aller jusqu’à 4,75. Cela nécessitera des taux de vaccination plus élevés pour contrôler la propagation.

De plus, la variante indienne B1617 a été estimée au moins 50% plus contagieuse que le B117, ce qui pourrait porter le R0 à plus de 7 et nous emmène en territoire inconnu.

Cela pourrait expliquer la situation catastrophique en Inde, mais augmente également les enjeux de la vaccination, car les vaccins à faible efficacité ne pourront pas contenir efficacement ces variantes hautement transmissibles.

L’immunité collective est encore possible, mais dépend de l’efficacité du vaccin utilisé et de la proportion de personnes vaccinées.

Une étude de modélisation au Royaume-Uni a révélé que l’utilisation de vaccins à très faible efficacité entraînerait à peine une rupture de l’économie sur dix ans, car elle ne parviendrait pas à contrôler la transmission. D’un autre côté, l’utilisation de vaccins à très haute efficacité se traduirait par de bien meilleurs résultats économiques.

Vacciner le monde est le seul moyen de mettre fin à la pandémie

Alors que la pandémie continue de s’aggraver dans certaines régions du monde, le risque augmente de mutations plus dangereuses qui sont résistantes aux vaccins ou trop contagieuses pour être contrôlées avec les vaccins actuels.

Suivre les mutations, c’est comme un coup de taupe pendant que la pandémie fait rage.

Le message à retenir pour notre stratégie de sortie de la pandémie est que plus tôt nous ferons vacciner le monde entier, plus tôt nous contrôlerons l’émergence de nouvelles variantes.

C Raina MacIntyre reçoit un financement du NHMRC et du MRFF. Elle a consulté ou siégé à des comités consultatifs sur les vaccins COVID-19 pour AstraZeneca, Seqirus et Janssen.

/ Avec l’aimable autorisation de The Conversation. Ce matériel provient de l’organisation d’origine et peut être de nature ponctuelle, édité pour plus de clarté, de style et de longueur.