Comparaison des ondes SARS-CoV-2 Delta et Omicron en Allemagne

Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont comparé les résultats et les caractéristiques des patients hospitalisés atteints du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) pendant les périodes dominantes des variantes SARS-CoV-2 Delta et Omicron en Allemagne.

Étude : Caractéristiques et résultats des patients COVID-19 pendant la dominance de B.1.1.529 (Omicron) par rapport à B.1.617.2 (Delta) dans 89 hôpitaux allemands. Crédit d’image : karegg/Shutterstock

Arrière-plan

La variante préoccupante (VOC) du SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) a été initialement signalée fin novembre 2021, et elle est rapidement devenue la variante la plus répandue dans le monde. Les rapports existants indiquent qu’Omicron induit une forme moins grave de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) que le précédent COV SARS-CoV-2 B.1.617.2 (Delta) dominant à l’échelle mondiale.

Les données sur les variations des caractéristiques et les résultats à l’hôpital des patients COVID-19 en Allemagne pendant la dominance Omicron par rapport à la dominance Delta ne sont pas soigneusement évaluées. En outre, la surveillance des infections respiratoires aiguës sévères (IRAS) est une caractéristique essentielle du contrôle des maladies infectieuses en Allemagne.

À propos de l’étude

Dans la présente étude, les chercheurs ont évalué les résultats et les caractéristiques des patients COVID-19 hospitalisés en Allemagne et ont estimé la gravité du COVID-19 induite par Omicron, ainsi que les schémas temporels pendant la période de transition B.1.617.2 à B.1.1.529. Pour ceci, l’équipe a examiné la fréquence de SARI dans les patients COVID-19.

Les scientifiques ont analysé rétrospectivement les données administratives obtenues auprès de 89 hôpitaux Helios allemands. Alors que les cas de COVID-19 confirmés en laboratoire étaient définis par la Classification statistique internationale des maladies et des problèmes de santé connexes version 10, code de modification allemand U07.1 (ICD-10-GM-code U07.1), les patients SARI étaient identifiés par la CIM -10 codes J09-J22. De plus, les patients infectés par le SRAS-CoV-2 ont été classés par SARI coïncidant, c’est-à-dire 1) SARI+ (COVID-19 avec SARI) et 2) SARI- (COVID-19 sans SARI). Au total, 4 494 patients hospitalisés ont été évalués dans le cadre de cette enquête.

Compte tenu de la variante dominante du SRAS-CoV-2 (transition B.1.617.2, B.1.617.2 à B.1.1.529 et B.1.1.529), un délai d’observation de neuf semaines a été conçu et divisé en trois étapes entre le 6 décembre 2021 et le 6 février 2022, dans cette étude. Chez les patients COVID-19 hospitalisés, les résultats ont été évalués à l’aide d’une analyse de régression et contrôlés en fonction du sexe, des comorbidités d’Elixhauser et de l’âge.

Les cas de COVID-19 depuis le début de 2020 sont stratifiés par SARI codé. Les barres colorées représentent trois phases par rapport aux variantes dominantes du SARS-CoV-2. SARI = Infection Respiratoire Aiguë Sévère ; SARI- = COVID-19 sans SARI ; SARI+ = COVID-19 avec SARI

Résultats et discussions

Les résultats de l’étude ont montré que le SARI était fréquent chez les patients atteints du SRAS-CoV-2, les quatre premières vagues pandémiques de COVID-19 montrant les taux d’occurrence les plus élevés. Néanmoins, les patients SARI- étaient plus nombreux que les patients SARI+ pendant la période de transition de Delta à Omicron. Le pourcentage de patients SARI+ est passé de 64,3 % dans la période dominante Delta à 30,6 % dans la période dominante Omicron.

En outre, les résultats ont démontré un changement spectaculaire des caractéristiques des patients COVID-19 au cours de la période dominante d’Omicron. Les patients COVID-19 de la période dominante Omicron étaient plus jeunes, de sexe féminin et présentaient des comorbidités réduites par rapport à la période dominante Delta. L’âge moyen de la cohorte totale du SRAS-CoV-2 est passé de 61,6 à 47,8 ans avec la transition Delta-à-Omicron.

Pendant la dominance d’Omicron, les patients COVID-19 du groupe SARI+ étaient plus âgés que la cohorte SARI-. En outre, le pourcentage de patients masculins atteints de COVID-19 a considérablement diminué pour l’ensemble de la cohorte. La cohorte globale a enregistré une baisse substantielle de l’indice de comorbidité Elixhauser moyen pondéré de 8,2 pendant la période dominante Delta et de 5,4 pendant la période dominante Omicron, et la cohorte SARI-, mais pas la cohorte SARI+.

Les patients atteints du SRAS-CoV-2 pendant la période dominante d’Omicron étaient moins susceptibles de nécessiter une admission en unité de soins intensifs (USI) et une ventilation mécanique, et ils avaient un risque de mortalité diminué dans l’ensemble de la cohorte et les cohortes SARI+ que dans la période dominante Delta. En revanche, aucune réduction drastique du risque n’a été observée dans le groupe SARI pour le traitement en USI et la ventilation mécanique pendant la période dominante d’Omicron, alors que les décès à l’hôpital ont été réduits. De plus, la durée de la ventilation mécanique, du séjour en soins intensifs et du séjour à l’hôpital a chuté dans la cohorte totale pendant la période dominante d’Omicron par rapport à celle de Delta. De même, la durée d’hospitalisation et la durée de la ventilation mécanique ont été réduites dans la cohorte SARI+.

Par conséquent, les auteurs ont déclaré qu’Omicron induit peut-être un COVID-19 moins sévère. La survenue simultanée de SARI semble être liée à la gravité du COVID-19 chez les patients hospitalisés. Par conséquent, la surveillance SARI pourrait être essentielle pour la surveillance de la pandémie de COVID-19.

conclusion

Selon les auteurs, il s’agissait de la première étude comparant les résultats des patients COVID-19 pendant les quatrième et cinquième vagues pandémiques du SRAS-CoV-2 en Allemagne sur la base des COV viraux dominants.

Les résultats de l’étude ont indiqué que les patients COVID-19 pendant la période dominante d’Omicron étaient plus jeunes, plus susceptibles d’être des femmes et avaient une charge de comorbidité inférieure à celle de la période dominante Delta. Les patients atteints du SRAS-CoV-2 présentaient un risque considérablement réduit de ventilation mécanique, de décès à l’hôpital et de traitement en USI pendant la période dominante d’Omicron par rapport à celle de Delta. Ce résultat était également vrai pour la cohorte SARI+. De plus, la cohorte SARI- avait plus de cas que SARI+ pendant la période de transition Delta-à-Omicron et la période dominante d’Omicron.

Dans l’ensemble, le présent travail a illustré que les caractéristiques et les résultats des patients COVID-19 variaient pendant la période dominante d’Omicron par rapport à la période dominante de Delta, indiquant que les infections à Omicron étaient moins graves. En outre, l’étude indique qu’une surveillance SARI persistante basée sur le code ICD pourrait être essentielle dans la surveillance du COVID-19 et déterminer la gravité des futures souches mutantes du SRAS-CoV-2. Néanmoins, d’autres études sont nécessaires pour corroborer cette observation.

*Avis important

medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.