Un laboratoire de haute technologie utilise une technologie de pointe pour stimuler la future réponse de Singapour à la pandémie

Nanyang Technological University, Singapour (NTU Singapore) et Pathnova Laboratories, une société de diagnostic médical soutenue par Temasek Life Sciences Accelerator et basée au Temasek Life Sciences Laboratory, contribuent à la capacité de diagnostic COVID-19 de Singapour grâce à son partenariat dans un nouveau laboratoire de diagnostic clinique.

Au milieu de la situation mondiale actuelle du COVID-19, le laboratoire prévoit d’exploiter des technologies de pointe telles que l’intelligence artificielle (IA) et l’analyse de données pour innover, renforçant ainsi la future réponse du pays à la pandémie.

Situé sur le campus Novena de la Lee Kong Chian School of Medicine (LKCMedicine) de NTU Singapore, le laboratoire de diagnostic clinique de NTU a été créé en avril 2020 par une équipe de chercheurs universitaires, à l’appui de l’effort national visant à augmenter la capacité de test de diagnostic et a commencé Covid-19 test de réaction en chaîne par polymérase (PCR) le 1er juillet 2020.

Le partenariat entre NTU et Pathnova a débuté le 1er mars 2021, Pathnova assurant les opérations et NTU continuant de soutenir et d’héberger le laboratoire. Depuis lors, le laboratoire maintenant connu sous le nom de Pathnova Laboratories @ LKCMedicine, a intensifié ses opérations et a été engagé par le ministère de la Santé de Singapour pour tester des écouvillons de plus de 120 000 personnes, y compris des tests de routine pour les résidents des dortoirs de travailleurs étrangers.

Avec une capacité de test de 2 000 tests par jour, le laboratoire s’est préparé à des tests à grande échelle et à des délais d’exécution plus rapides grâce à l’automatisation et à l’augmentation des types de tests SARS-CoV-2 disponibles.

Compte tenu de son accent sur la sérologie, Pathnova a également étendu ses capacités aux tests de sérologie COVID-19 au laboratoire de diagnostic. Ces tests sont destinés à détecter des infections passées ou à évaluer la réponse en anticorps d’un individu après la vaccination.

Se préparer aux futures pandémies

Alors que le laboratoire sort inévitablement de COVID-19, la vision est d’utiliser les leçons tirées des tests de pandémie pour réinventer un nouveau genre de laboratoire qui est flexible et évolutif grâce à la robotique open source et à l’automatisation logicielle.

Un tel laboratoire sera évolutif mais adaptable, par exemple en utilisant des processus numériques intelligents pour assurer la qualité et la productivité des tests quotidiens, tout en permettant aux experts scientifiques d’apporter des innovations et des améliorations aux flux de travail du laboratoire.

M. Peter Chia, PDG de Temasek Life Sciences Accelerator, a déclaré : « Nous sommes ravis de travailler avec un établissement de santé de renommée mondiale comme LKCMedicine. Nous sommes convaincus que de tels partenariats de collaboration découlent d’une science de qualité et de personnes passionnées travaillant ensemble, capitalisant sur la dynamique de la réponse de la communauté scientifique internationale à cette crise, pour apporter des solutions innovantes pour le bien public.

Je tiens à féliciter LKCMedicine et Pathnova pour ce partenariat. Nous sommes impatients de voir des solutions plus innovantes de leur part au profit des communautés de Singapour et de la région. »

Le professeur Lam Khin Yong, vice-président principal (Recherche) de NTU, a déclaré : « La collaboration de NTU avec Pathnova Laboratories permettra à nos scientifiques de tirer parti de leur expertise dans les technologies d’intelligence artificielle pour relever les futurs défis pandémiques. Nous attendons avec impatience comment cette synergie entre les universités et l’industrie apporter des résultats significatifs qui contribuent à l’effort national plus important pour protéger la santé de la population. »

Exploration de la détection et du diagnostic accélérés du SRAS-CoV-2

Soutenu par des experts dans les domaines de la génomique, de l’informatique et de la bio-ingénierie, le laboratoire Pathnova Laboratories @ LKCMedicine explorera les moyens de simplifier et de raccourcir les protocoles complexes. Créant un nouveau type de laboratoire moléculaire, il fonctionnera sur du matériel et des logiciels open source, sera entièrement intégré, reconfigurable et résistant aux goulots d’étranglement de la chaîne d’approvisionnement.

Par exemple, le laboratoire cherchera à utiliser une technologie de pointe pour accélérer l’innovation grâce à l’analyse des données et à l’automatisation de l’IA, en activant la robotique et les algorithmes mathématiques pour augmenter l’efficacité et réduire les coûts opérationnels.

Le vice-président principal de NTU (Santé et sciences de la vie) et Dean NTU Lee Kong Chian School of Medicine (LKCMedicine), le professeur distingué de l’Université Joseph Sung ont déclaré : « Comme nous l’avons vu et expérimenté avec le coronavirus, les virus mutent et les maladies évoluent, mais heureusement, la technologie a également évolue – souvent en notre faveur. En tirant parti de la technologie de la virologie moléculaire et en nous associant à l’industrie, nous pouvons travailler ensemble pour renforcer la préparation future de Singapour en cas de pandémie. »

Étant le seul laboratoire de service de diagnostic mis en place par un institut d’enseignement supérieur en réponse rapide à l’exigence nationale, le laboratoire rassemble deux excellents experts dans le domaine.

Il est codirigé par le professeur agrégé Eric Yap de LKCMedicine, qui est le directeur médical du nouveau laboratoire, et le Dr Ian Cheong, directeur scientifique et co-fondateur de Pathnova Laboratories.

NTU et Pathnova partagent un esprit similaire. Nous construisons des choses de manière légère et à partir de principes premiers, dans une optique de performances évolutives et cohérentes lorsqu’elles sont utilisées dans le monde réel. Notre partenariat a été catalysé dans le creuset du COVID-19. Nous sommes heureux de cette opportunité significative de contribuer ensemble à la réouverture en toute sécurité de Singapour. »

Dr Ian Cheong, directeur scientifique et co-fondateur, Pathnova Laboratories

Assoc Prof Yap, qui a travaillé comme médecin et scientifique de la défense, étudie les modèles et les effets de la variation génétique dans les génomes humains, bactériens et viraux, exploitant ces différences pour un diagnostic plus précis et plus rapide des maladies.

En avril 2020, le professeur Assoc Yap et son équipe de chercheurs ont mis au point un moyen d’accélérer le test PCR COVID-19, donnant des résultats en seulement 36 minutes avec un équipement et des capacités limités. Leur test PCR direct est utilisé pour rechercher des séquences génétiques COVID-19 dans des échantillons bruts sans avoir besoin d’étapes de purification d’ARN longues et manuelles, qui sont nécessaires dans les tests PCR actuels.

Le Dr Ian Cheong, qui a une formation d’avocat et de scientifique, a une formation en thérapeutique expérimentale et en diagnostic du cancer. En 2017, avec le soutien de Temasek Life Sciences Accelerator (TLA), il a cofondé Pathnova Laboratories avec le professeur émérite Chan Soh Ha et M. Jason Foo pour développer une détection évolutive du cancer du nasopharynx et des maladies auto-immunes grâce à la détection sérologique, accélérée par l’apprentissage automatique.