L’Inde détecte une nouvelle variante «  double mutant  » alors que les cas de Covid-19 augmentent, avec des craintes d’une deuxième vague


Un variant «double mutant» est une souche virale qui porte deux mutations. On ne sait pas encore combien d’infections ont été liées à cette double variante mutante, ou si la souche est plus dangereuse, mais le ministère a déclaré que « de telles mutations confèrent une fuite immunitaire et une infectivité accrue ».

Selon le ministère, le nombre de cas connus liés à la double mutation n’était pas suffisamment élevé pour expliquer la flambée actuelle des infections à l’échelle nationale,

L’Inde a enregistré 53 476 nouveaux cas de Covid-19 jeudi – la plus forte augmentation en un jour en cinq mois. La dernière fois que le décompte quotidien a été aussi élevé, c’était le 23 octobre, selon un décompte CNN de chiffres du ministère de la Santé.

La première vague d’infections du pays a commencé à grimper l’été dernier et a culminé en septembre, les chiffres diminuant lentement depuis lors. En février de cette année, le nombre de cas quotidiens avait chuté de près de 90%, à environ 10 000 par jour.
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Mais au début du mois de mars, il est devenu clair que les cas augmentaient lentement à nouveau – et ils ont explosé au cours des dernières semaines.

L’Inde a maintenant signalé un total de plus de 11,7 millions de cas et 160000 décès liés, selon les données de l’Université Johns Hopkins.

« Je dirais que c’est le début d’une deuxième vague », a déclaré mercredi Randeep Guleria, directeur de l’Institut indien des sciences médicales. « C’est quelque chose qui a déjà été vu dans de nombreux pays européens; nous semblons les suivre. »

Il y a un certain nombre de facteurs – l’un étant la fatigue Covid, et la possibilité que les gens soient moins prudents en raison de la baisse hivernale des infections. « Vous voyez que dans la communauté, lorsque vous sortez, le port d’un masque est devenu de moins en moins important », a déclaré Guleria. « Nous voyons des foules se développer, faire la fête, beaucoup de cérémonies de mariage se déroulent en Inde. »

Un autre facteur pourrait être la montée en puissance de « variantes qui viendront en Inde d’autres parties du monde », a-t-il dit, soulignant la souche détectée pour la première fois au Royaume-Uni, qui s’est depuis propagée dans de nombreux États indiens …

Variantes et mutations

Tous les virus évoluent avec le temps et apportent parfois des modifications lorsqu’ils se répliquent, provoquant des mutations. Certaines mutations ont peu d’effet – mais d’autres pourraient rendre la variante plus facilement transmissible ou provoquer des infections avec des symptômes plus graves.

D’après le ministère de la Santé, 771 cas de variantes préoccupantes ont été détectés sur environ 10787 échantillons analysés par le consortium indien SARS-CoV-2 sur la génomique dans 18 États. Trente-quatre étaient la variante identifiée pour la première fois en Afrique du Sud et une était la variante P.1 du Brésil.

Bien que le ministère ait déclaré que ceux-ci ne sont pas corrélés à la récente flambée des cas, les variantes ont pour la plupart été détectées dans les États de «grave préoccupation» qui enregistrent les nombres les plus élevés, notamment au Pendjab et au Maharashtra. Et maintenant, des mutations doubles ont été signalées.

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Jusqu’à présent cette année dans le Maharashtra, « il y a eu une augmentation de la fraction d’échantillons avec les mutations E484Q et L452R », a déclaré le ministère dans son communiqué de presse. Ils ont été trouvés dans 15 à 20% des échantillons et ne correspondent à aucune variante préoccupante précédemment cataloguée, a déclaré le ministère, ajoutant que « de telles mutations confèrent une fuite immunitaire et une infectivité accrue ».

Il n’est pas inhabituel de voir plusieurs mutations dans une seule variante. «Tous ces virus (variants) auxquels nous avons affaire sont déjà des mutants», a déclaré le virologue T Jacob John. La souche qui est devenue répandue dans le monde était déjà différente de la première souche originaire de Wuhan, en Chine, a-t-il ajouté.

La souche trouvée pour la première fois au Royaume-Uni, officiellement appelée variante B.1.1.7, a 23 mutations par rapport à la souche originale trouvée à Wuhan, selon l’American Society of Microbiology.
Le variant brésilien connu sous le nom de P.1 a 17 mutations, et le variant sud-africain connu sous le nom de B.1.351 a également plusieurs mutations, selon les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis.

La dangerosité d’une mutation dépend de l’endroit où elle se produit dans le virus. Par exemple, la variante sud-africaine présente des mutations qui modifient la structure de la protéine de pointe, qui semblent affecter le domaine de liaison au récepteur – la partie de la protéine de pointe la plus importante pour la fixation et l’infection des cellules. Les chercheurs étudient actuellement s’il pourrait aider le virus à échapper en partie aux effets des vaccins.

Guleria a averti qu’une double mutation n’était pas nécessairement un motif d’alerte, car les chercheurs étudient toujours l’effet des mutations.

« Ils ne savent pas exactement quelle en est la signification », a-t-il déclaré. « Est-ce que cela a une signification clinique ou est-ce juste une observation? Et cela doit être lié aux données épidémiologiques, ce qui est fait. »

Une question est de savoir quelles variantes – et quelles mutations – pourraient échapper aux effets de nos vaccins existants.

« Si quelqu’un a été infecté par un coronavirus il y a six mois, cette personne est immunisée contre le coronavirus non muté », a déclaré John. « Mais la personne est-elle toujours immunisée contre les variantes? (Cela doit être) étudié. »

Campagne de vaccination en Inde

Dans l’intervalle, les autorités indiennes s’efforcent de contrôler le pic en mettant en œuvre de nouvelles restrictions et en intensifiant le programme de vaccination du pays.

L’Inde administre deux vaccins au niveau national. L’un est Covishield, un vaccin développé par l’Université d’Oxford et AstraZeneca et produit par le Serum Institute of India, le plus grand fabricant de vaccins au monde. L’autre est le premier vaccin contre le coronavirus en Inde, Covaxin, développé conjointement par Bharat Biotech et le Conseil indien de la recherche médicale géré par le gouvernement.

Jusqu’à présent, l’Inde a administré plus de 50 millions de doses de vaccins, avec plus de 8,1 millions de personnes entièrement vaccinées, selon l’Université Johns Hopkins.

Le Serum Institute of India ne produit pas seulement la plupart des vaccins pour l’Inde, il est également responsable de la plupart des vaccins distribués dans le reste du monde. En septembre de l’année dernière, SII s’est engagée à fabriquer et à livrer 200 millions de doses de COVAX – une alliance de vaccins de l’OMS mise en place pour garantir un accès équitable aux vaccins Covid-19.

Mais SII a dû interrompre ou retarder ses exportations à plusieurs reprises au cours des derniers mois alors que la demande mondiale et intérieure augmentait.

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Le 4 janvier, l’Inde a limité l’exportation du vaccin AstraZeneca produit par SII au moins jusqu’au mois de mars. « Nous avons reçu une licence restreinte uniquement pour la donner et la fournir au gouvernement indien parce qu’ils veulent d’abord donner la priorité aux segments les plus vulnérables et les plus nécessiteux », a déclaré à l’époque le PDG de SII, Adar Poonawalla. « La seule condition est que nous ne pouvons fournir qu’au gouvernement indien, nous ne pouvons pas le vendre sur le marché privé et nous ne pouvons pas l’exporter. »

Jeudi, Reuters a rapporté que l’Inde retarderait probablement les livraisons de vaccins AstraZeneca à COVAX, citant l’UNICEF. L’Inde avait suspendu temporairement toutes les principales exportations de clichés AstraZeneca fabriqués par SII pour répondre à la demande intérieure, selon Reuters.

CNN a contacté SII, l’UNICEF et le ministère des Affaires extérieures pour obtenir des commentaires, mais n’a pas encore reçu de réponse.

Le ministère de l’Intérieur a également introduit mardi de nouvelles directives de lutte contre les infections, qui seront en place jusqu’à la fin du mois d’avril. Certaines des mesures comprennent l’isolement rapide des cas positifs et la recherche de leurs contacts dans les 72 heures.

Plusieurs villes et États, dont Mumbai, Delhi et Odisha, ont interdit les rassemblements pendant Holi, le prochain festival des couleurs, le 28 mars.

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