Le Missouri suit l’augmentation de la variante delta par le biais du système d’assainissement

COLUMBIA, Mo. – Les experts disent qu’une souche hautement contagieuse de Covid-19 se propage rapidement à travers le Missouri, en particulier dans les petites communautés rurales où les taux de vaccination sont lents.

La souche, connue sous le nom de variante delta, détectée pour la première fois en Inde, a été trouvée dans les eaux usées d’au moins 10 comtés, selon un examen NBC des données du « Sewershed Surveillance Project » de l’État.

« Depuis environ la deuxième semaine de mai, nous avons constaté une très forte augmentation de la prévalence du variant delta », a déclaré Marc Johnson, professeur de microbiologie moléculaire et d’immunologie à l’Université du Missouri. « Et la vitesse à laquelle il s’est propagé est assez incroyable. Il s’est propagé très rapidement à travers l’État. »

Johnson et son collègue Chung-Ho Lin, professeur agrégé de recherche et scientifique principal du programme de bioremédiation de l’université, ont travaillé avec le Missouri Department of Health and Senior Services et le Department of Natural Resources pour suivre le coronavirus dans les eaux usées, la collaboration commençant l’été dernier.

Le laboratoire de Johnson se concentre sur la séparation du virus des plus grosses particules de déchets et sur l’extraction de son matériel génétique. Les chercheurs peuvent amplifier le matériel génétique et l’étudier plus en détail, grâce à un processus connu sous le nom de réaction en chaîne par polymérase de transcription inverse quantitative.

C’est une entreprise qui prend du temps, mais qui, selon les experts, peut être un outil d’atténuation très efficace. En plus de détecter la présence du virus à l’origine du Covid-19 dans les déchets humains, les chercheurs sont capables d’identifier des variantes spécifiques.

« C’est juste un moyen beaucoup plus complet d’étudier la propagation du virus », a expliqué Johnson. « Quand vous comptez sur des tests humains, vous comptez sur des personnes qui ont été testées, qui ont accès aux soins de santé et ainsi de suite. Notre système vous parlera d’une ville entière sans aucun parti pris. Tant que vous utilisez le système d’égout, nous le détecterons. »

Chaque semaine, le ministère de la Santé et des Services aux personnes âgées envoie aux équipes de l’université de quatre à 50 boîtes d’échantillons d’eaux usées provenant d’installations de traitement à travers l’État.

Les chercheurs ont détecté pour la première fois la variante delta le 10 mai dans les eaux usées de Branson. La même semaine, ils l’ont trouvé dans les eaux usées collectées à quelque 235 miles de là, à Brookfield.

C’était le début d’un schéma qui inquiète les officiels. Branson et Brookfield sont toutes deux des villes plus petites, avec de faibles taux de vaccination, dans un État où seulement 38 pour cent des résidents sont complètement vaccinés. À l’échelle nationale, plus de 45% des Américains éligibles sont entièrement vaccinés.

« Nous ne parlons pas d’une ville continue. Il s’agit de nombreuses petites communautés individuelles », a déclaré Johnson. « C’est inquiétant que cela se propage si rapidement. »

Dans le comté de Linn, siège de Brookfield, moins d’un tiers des résidents sont entièrement vaccinés. L’administratrice de la santé du comté de Linn, Krista Neblock, a déclaré à NBC News que le taux de vaccination et la présence de la variante delta sont déconcertants.

« Si vous m’aviez demandé début mai si j’aurais pensé fin mai que nous serions dans la situation dans laquelle nous nous trouvions, j’aurais dit non », a-t-elle déclaré. « En novembre, lorsque nous n’avions pas affaire à cette variante dans notre communauté, nous avions peut-être un ou deux membres d’un ménage testés positifs. Mais maintenant, nous avons vu des ménages entiers testés positifs et appliquer les mêmes directives d’atténuation et d’isolement que nous avons fait la promotion tout au long de la pandémie. »

Neblock a déclaré que la variante delta semble se propager beaucoup plus rapidement que les variantes précédentes. Les Centers for Disease Control and Prevention ont déclaré la semaine dernière que la variante est une « variante préoccupante ». Ce statut s’applique à une variante lorsqu’il y a des raisons de croire qu’elle est plus transmissible, ou provoque des cas plus graves ou que les vaccins et les traitements sont moins efficaces contre elle.

Neblock a déclaré que la vague actuelle de cas de Covid-19 dans le comté a conduit à un taux d’hospitalisation d’environ 14%, et que les personnes hospitalisées sont plus jeunes, âgées de 20 à 60 ans et en grande partie non vaccinées.

« J’espère vraiment que cette vague a ouvert un peu les yeux de notre communauté sur l’importance du vaccin », a déclaré Neblock.