La prévalence des virus zoonotiques transmis par les rongeurs en Europe parmi les petits mammifères habitant les paysages agricoles

Dans le nord-ouest de l’Espagne, les scientifiques ont examiné 526 petits mammifères sauvages à la recherche de virus zoonotiques et identifié plusieurs virus, tels que l’hantavirus, l’orthopoxvirus et l’arénavirus. Leurs conclusions ont été documentées dans une étude disponible en Maladies infectieuses émergentes.

Arrière-plan

Les scientifiques ont déclaré que les virus zoonotiques menacent les êtres humains en raison du risque de propagation. C’est pourquoi il est extrêmement important de dépister et d’identifier régulièrement les virus zoonotiques potentiels pouvant infecter l’homme. Des études antérieures ont rapporté que les rongeurs sont les principaux réservoirs des zoonoses émergentes. Ces études ont également révélé que les fluctuations de la population de réservoirs zoonotiques (par exemple, les rongeurs) pourraient moduler le risque d’infection.

Certains facteurs qui augmentent le risque d’invasion de rongeurs et augmentent la possibilité de propagation d’agents pathogènes comprennent les changements anthropiques dans l’utilisation des terres, l’irrigation et les pratiques agricoles intensifiées. Les scientifiques ont rapporté que Microtus arvalis (campagnol commun) est un rongeur commun dans les zones agricoles du nord-ouest de l’Espagne. Dans le passé, le débordement de bactéries zoonotiques, par exemple, Francisella tularensis et Bartonelle spp, ont été signalés dans cette zone.

Une nouvelle étude

Dans cette étude, les chercheurs ont examiné un total de 526 animaux individuels appartenant à quatre espèces. Les scientifiques ont signalé la présence de virus zoonotiques transmis par des rongeurs, tels que l’hantavirus, l’arénavirus et l’orthopoxvirus, en Europe. Ces virus sont répandus parmi les petits mammifères habitant les terres agricoles. De plus, les chercheurs ont observé une dépendance de phase, c’est-à-dire que les fluctuations naturelles du nombre de campagnols communs affectent la prévalence virale.

Cette étude est basée sur des paysages agricoles de la région Tierra de Campos de Castilla-y-León, au nord-ouest de l’Espagne. Cette zone est dominée par quatre petits mammifères, à savoir, Apodemus sylvaticus (mulot à longue queue), Microtus arvalis (campagnol commun), Crocidura russule (musaraigne à dents blanches) et Mus spretus (souris de la Méditerranée occidentale).

Dans la présente étude, les chercheurs ont capturé des petits mammifères vivants entre mars 2013 et mars 2019. Ils ont obtenu différents échantillons comprenant du sang, du foie, de la rate et des poumons et ont été conservés à -23 °C. Les scientifiques ont effectué une analyse moléculaire de ces échantillons.

Principales conclusions

Les chercheurs ont effectué un test d’immunofluorescence et ont détecté la présence d’IgG d’hantavirus, d’arénavirus et d’orthopoxvirus dans des échantillons de sérum. Dans cette étude, les scientifiques ont utilisé l’isothiocyanate de fluorescéine (FITC) anti-IgG comme anticorps secondaire et ont étudié les échantillons au microscope à fluorescence.

Les auteurs ont isolé l’ARN des tissus pulmonaires et hépatiques et l’ADN de la rate et du foie. Ces échantillons ont été utilisés pour l’analyse moléculaire. L’arénavirus a été détecté dans les échantillons de foie et l’hantavirus a été identifié dans les échantillons de poumon à l’aide d’une PCR de transcription inverse en une seule étape (RT-PCR). Cependant, l’orthopoxvirus a été détecté à partir du mélange d’échantillons de rate et de foie en utilisant la méthode conventionnelle de PCR pan-poxvirus suivie d’une méthode de PCR spécifique.

L’étude actuelle a rapporté que l’hantavirus était couramment répandu chez 1,6 % des campagnols communs, tandis que l’arénavirus a été identifié chez 5,9 % des mulots à longue queue et 2,2 % des campagnols communs. Les chercheurs ont en outre détecté l’orthopoxvirus chez 1,3 % des campagnols communs et 48 % des souris de la Méditerranée occidentale. Fait intéressant, les scientifiques ont observé que la prévalence de l’arénavirus était significativement plus élevée chez les hommes que chez les femmes.

Des études antérieures liées aux zoonoses virales en Espagne ont signalé une faible prévalence d’arénavirus et d’hantavirus chez l’homme. Ces études ont également détecté la présence d’anticorps contre l’hantavirus chez le renard roux et d’anticorps contre l’arénavirus chez le renard roux et le mulot à longue queue.

Les scientifiques ont rapporté que bien que la prévalence de l’hantavirus soit faible et ne variait pas entre les phases du cycle de population de campagnols communs, elle abritait les trois virus dépistés, ce qui pourrait augmenter le risque associé de propagation du virus. Pendant le pic de population, la densité de campagnols communs peut atteindre 1 000 par hectare. Les chercheurs ont déclaré que le risque d’infection par l’orthopoxvirus augmentait en Europe parce qu’il n’y avait pas de vaccination contre la variole pour la population humaine de plus de 45 ans.

Études futures

Les auteurs ont déclaré que davantage d’analyses moléculaires doivent être menées à l’avenir et que l’infectivité de l’hantavirus et de l’orthopoxvirus doit être analysée. De plus, les voies de circulation doivent être identifiées, ce qui aidera à déterminer les voies de transmission possibles ainsi que le degré de risque d’infection dans la population humaine. Les scientifiques pensent que cette étude aidera les autorités locales à améliorer leurs stratégies de surveillance des virus afin de prévenir et de minimiser les retombées zoonotiques, en particulier pour les personnes résidant à proximité des terres agricoles.