La carte révèle comment Covid s’est répandu dans le monde au cours de l’année de verrouillage

La propagation rapide de Covid-19 dans le monde a été révélée sur une carte alors que le Royaume-Uni marque sa première année depuis le début du verrouillage.

L’instantané à code couleur montre comment le coronavirus a sauté d’une région à l’autre alors qu’il commençait à se propager à la fin du mois de décembre 2019.

Le Royaume-Uni marque un an après le début de la première annonce de verrouillage aujourd’hui au milieu de nouveaux avertissements concernant la menace de nouvelles variantes en provenance de l’étranger.

Une augmentation de la mutation sud-africaine en France préoccupe particulièrement les responsables de la santé britanniques, avec une amende de 5000 £ pour partir en vacances à l’étranger qui doit être introduite à partir de lundi.

On s’attend à ce que la sanction – interdiction de voyager sans «excuse raisonnable» comme pour des raisons professionnelles ou familiales – restera en vigueur jusqu’à la fin du mois de juin.

Alors que l’effort de vaccination de masse sans précédent du Royaume-Uni a été salué comme le plus grand du genre au monde, les graphiques produits par Nextstrain, un effort collaboratif ancré par des scientifiques européens, montrent comment Covid évolue et s’adapte constamment.

La chercheuse Emma Hodcroft, épidémiologiste moléculaire à l’Université de Berne en Suisse, a expliqué: «Le virus mute tout le temps. C’est une partie normale de la vie du virus et beaucoup de ces mutations ne font rien du tout.

«  Nous utilisons des séquences pour créer ces arbres généalogiques essentiellement pour montrer les relations, mais nous sommes toujours à la recherche de signes pour montrer que quelque chose a changé.  »

Nextstrain, un site Web d’analyse open source géré par des chercheurs d’universités à travers l’Europe, met continuellement à jour les clades – ou groupes d’organismes – sur la base de séquences provenant de laboratoires du monde entier. Ils comprennent le Wellcome Sanger Institute pour le Covid-19 Genomics UK Consortium.

Les régions présentées dans le graphique comprennent l’Afrique (vert), l’Asie (bleu), l’Europe (citron vert), l’Océanie (bleu clair) et l’Amérique du Sud et du Nord (orange et rouge).

Même lorsqu’une variante émerge, les changements qui ont lieu chez un humain infecté signifient qu’une nouvelle chaîne de sous-types se développe plus loin le long de la ligne.

Les changements dans la protéine de pointe que le virus utilise pour détourner efficacement les cellules humaines sont particulièrement préoccupants pour les scientifiques. Potentiellement, cela pourrait signifier que les vaccins deviennent moins efficaces contre l’infection, bien que des études aient montré que les vaccins actuels sont résistants aux changements.

Les cartes renforcent également l’opinion du Dr Hodcroft, précédemment exprimée à Metro.co.uk, selon laquelle retenir de nouvelles variantes doit être une entreprise internationale au-delà des frontières.

Le graphique présenté dans l’animation gif de Metro.co.uk ci-dessous commence en décembre 2019, les plus grandes sources d’infections se trouvant en Asie, en Amérique du Nord et en Océanie, et se termine en mars 2021.

Les données correspondantes présentées dans un «arbre généalogique» comprennent des séquences génétiques qui ont été capturées et partagées par des laboratoires du monde entier.

Il montre l’émergence de lignées dont B.1.1.7, également connue sous le nom de variante UK ou Kent, qui a été associée à un taux de mortalité plus élevé.

Les ramifications peuvent être retracées le long de la ligne des mutations antérieures.

Le professeur Greg Towers, de la Division des infections et de l’immunité de l’University College London, a déclaré à Metro.co.uk: «  Ce que montrent ces cartes, c’est à quelle vitesse ce virus se déplace et à quelle vitesse il arrive.

«  Il fait deux choses, il s’adapte pour devenir un virus humain à part entière, plutôt qu’un virus de la chauve-souris, ce qui nécessite quelques changements, et il s’adapte pour échapper à l’immunité qui a été causée par la première vague d’infection.

«Et cela nous dit qu’il s’adaptera à l’immunité dans les première et deuxième vagues d’infection et ainsi de suite. Il faut donc que les vaccins soient mis à jour.  »

Le professeur Towers a comparé la lutte contre Covid au concept de la reine rouge dans À travers le miroir, qui a été transformé en théorie scientifique pour expliquer l’évolution.

«  Comme la reine rouge, où vous devez continuer à courir aussi vite que possible pour rester au même endroit, donc dans la course aux armements du virus hôte, les deux parties essaient constamment de prendre l’avantage  », a-t-il déclaré.

«Ainsi, par exemple, nous faisons une réponse immunitaire, puis le virus change pour échapper à cette réponse immunitaire. Alors qu’au cours des échelles de temps évolutives, les gens s’adaptent et deviennent moins sensibles aux virus, à court terme, les virus peuvent échapper à ces adaptations par des changements de séquence.

La méfiance à l’égard de la menace des nouvelles variantes a été soulignée aujourd’hui avec la nouvelle qu’une mutation de New York a trouvé son chemin vers le Royaume-Uni.

Public Health England a déclaré qu’il «  surveillait de près la situation  » et que la lignée B.1.526 ne contenait pas les mutations E484K ou S477N, qui préoccupent les scientifiques.

Meera Chand, directrice des incidents pour Covid-19, a déclaré: «Nous travaillons avec des partenaires du monde entier pour identifier et atténuer l’impact des variantes à mesure qu’elles apparaissent.

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