La nouvelle variante du coronavirus de New York inquiète les chercheurs

C’est « cultivé chez nous, vraisemblablement à New York », a déclaré le Dr David Ho, directeur du Aaron Diamond AIDS Research Center à Columbia, qui a dirigé l’équipe d’étude, par courrier électronique.

Les virus mutent tout le temps. Plus il y a de personnes infectées et plus longtemps elles sont infectées, plus les virus ont de chances de changer. Le corps d’un patient sera chargé de milliards de copies d’un virus et pourra être légèrement modifié ou muté. La plupart vont et viennent.

Mais parfois, une mutation ou un schéma de mutations s’installe et se transmet. Si les virus avec de tels modèles deviennent plus courants, ils sont appelés variantes. Encore une fois, il n’est pas inhabituel que des variantes apparaissent, mais si elles confèrent au virus des propriétés inquiétantes, telles qu’une meilleure transmissibilité ou la capacité d’échapper aux traitements et aux vaccins, c’est alors que les médecins commencent à s’inquiéter.

La mutation dans cette variante qui préoccupe le plus les chercheurs est appelée E484K et elle donne au virus la capacité de passer au-delà d’une partie de la réponse immunitaire de l’organisme, ainsi que des traitements par anticorps monoclonaux autorisés. Cette mutation apparaît indépendamment dans de nombreux cas différents, mais apparaît également dans une variante particulière – celle appelée B.1.526.

«C’est cette nouvelle variante qui augmente, de manière alarmante, dans notre population de patients au cours des dernières semaines», a écrit l’équipe de Columbia dans une copie de leur rapport fournie à CNN.

« Nous constatons que le taux de détection de cette nouvelle variante augmente au cours des dernières semaines. Une préoccupation est qu’elle pourrait commencer à dépasser d’autres souches, tout comme les variantes britanniques et sud-africaines », a déclaré Ho à CNN.

« Cependant, nous ne disposons pas de suffisamment de données pour confirmer ce point maintenant. »

Mais la mutation E484K est observée dans au moins 59 lignées différentes de coronavirus, ont-ils déclaré – ce qui signifie qu’elle évolue de manière indépendante à travers le pays et à travers le monde dans un phénomène connu sous le nom d’évolution convergente. Cela peut donner un avantage au virus.

« Tout ce que nous savons sur cette mutation clé suggère qu’elle semble échapper à la pression des anticorps », a déclaré Ho.

Mardi, deux équipes ont fait état d’une autre variante qui semble être à la hausse en Californie.

Ils craignent que la variante ne soit non seulement plus contagieuse, mais qu’elle puisse également causer une maladie plus grave. Comme dans le cas des rapports de New York, leur recherche en est à ses tout débuts, n’a pas été publiée ni examinée par des pairs et nécessite davantage de travail.

Une équipe de l’Université de Californie à San Francisco a testé des échantillons de virus provenant d’épidémies récentes à travers la Californie et a constaté que cela devenait beaucoup plus courant. Il n’a été observé dans aucun échantillon de septembre, mais à la fin de janvier, il a été trouvé dans la moitié des échantillons.

Cette variante, que l’équipe appelle B.1.427 / B.1.429, présente un schéma de mutations différent de celui des variantes vues pour la première fois au Royaume-Uni, appelées B.1.1.7 ou B.1.351. Une mutation, appelée L452R, affecte la protéine de pointe du virus, qui est le bit qui se fixe aux cellules infectées par le virus.

« Une mutation spécifique, la mutation L452R, dans le domaine de liaison au récepteur de la protéine de pointe peut permettre au virus de s’ancrer plus efficacement aux cellules. Nos données montrent que c’est probablement la mutation clé qui rend cette variante plus infectieuse, » Dr. Charles Chiu, directeur associé du laboratoire de microbiologie clinique de l’UCSF, qui a dirigé l’une des études, a déclaré à CNN.

Et ils ont trouvé des preuves que c’est plus dangereux. «Dans cette étude, nous avons observé une augmentation de la gravité de la maladie associée à l’infection par B.1.427 / B.1.429, y compris un risque accru de besoins élevés en oxygène», ont-ils écrit dans leur rapport, qui doit publier sur un serveur de pré-impression plus tard cette semaine. après que les responsables de la santé publique à San Francisco l’ont examiné.

Chiu a déclaré qu’elle devrait être désignée comme une variante préoccupante et qu’elle devrait être considérée comme une priorité d’étude.

Une deuxième équipe d’Unidos en Salud, une organisation à but non lucratif basée à San Francisco proposant des tests rapides dans le Mission District de San Francisco, a testé 8 846 personnes au cours du mois de janvier et séquencé le virus à partir de 630 des échantillons. Ils ont également constaté une augmentation rapide de la variante.

« Les résultats de la recherche indiquent que la variante L452R représente 53% des échantillons de test positifs collectés entre le 10 et le 27 janvier. C’est une augmentation significative par rapport à novembre lorsque notre séquençage a indiqué que cette variante ne représentait que 16% des tests positifs », Dr Diane Havlir, experte en maladies infectieuses à l’UCSF qui aide à mener l’étude, a déclaré dans un communiqué.

L’équipe de Havlir prépare également des résultats pour publication.