Les variantes du COVID-19 sont plus préoccupantes que celles signalées en Colombie-Britannique, selon les experts – BC News

Selon les experts, la Colombie-Britannique sous-déclare gravement le nombre de cas de COVID-19 qui sont des variantes préoccupantes, ce qui limite la sensibilisation du public à la menace.

Sarah Otto, professeure à l’Université de la Colombie-Britannique qui a effectué la modélisation du COVID-19, a déclaré que le recours de la province au séquençage du génome entier, qui prend du temps, pour confirmer les cas de variantes n’est pas nécessaire.

Elle a déclaré que le test PCR utilisé pour identifier tous les cas de COVID-19 dans la province détecte déjà une mutation que les trois principales variantes préoccupantes ont en commun. La Colombie-Britannique pourrait également adopter une méthode plus récente pour distinguer les variantes dans le cadre du test, a-t-elle ajouté.

Au lieu de cela, la province ne signale les cas qu’une fois qu’ils ont été confirmés par séquençage du génome entier. Otto a déclaré qu’elle ne croyait pas que la Colombie-Britannique ait la capacité de séquencer tous les cas de variantes présumées identifiés par le test PCR, et les sous-déclarait par conséquent.

Partager en temps opportun des informations complètes sur ces variantes plus transmissibles aiderait à enrôler davantage de résidents de la Colombie-Britannique dans «l’effort concerté» nécessaire pour freiner la propagation, a déclaré Otto.

« Si un patient arrive à l’hôpital et sait que c’est une variante, alors vous savez déjà que la personne court pratiquement le double du risque, et les médecins devraient donc traiter les cas avec plus de prudence », a-t-elle déclaré.

« De plus, si vous venez de l’obtenir et que vous réalisez que vous portez une variante, les gens peuvent être beaucoup plus prudents comme nous le voulons. »

La Colombie-Britannique a signalé 3766 cas qui sont des variantes préoccupantes à ce jour, dont 2838 du variant B.1.1.7 identifié pour la première fois au Royaume-Uni, 51 de la souche B.1.351 détectés pour la première fois en Afrique du Sud et 877 du variant P.1 trouvé pour la première fois au Brésil.

L’agent de santé provincial, le Dr Bonnie Henry, a déclaré mardi que 266 cas de variantes sont actifs, soit seulement 3% de l’ensemble des cas actifs.

Cependant, dans le même exposé, elle a également déclaré que la variante B.1.1.7 représentait un tiers des cas de la Colombie-Britannique et qu’elle s’attend à ce qu’elle atteigne 60%, rattrapant l’Ontario, dans environ un mois.

Jens von Bergmann, un mathématicien qui analyse les données, a déclaré que le chiffre de trois pour cent est un nombre «dénué de sens». La province n’effectue pas de séquençage de tous les cas de variantes, et pour ceux qu’elle séquencent, ils ne sont probablement plus actifs au moment où le travail est terminé, a-t-il déclaré.

Il a dit que B.1.1.7, qui constituait un tiers des infections de la Colombie-Britannique, semble plus précis, bien qu’il soupçonne que les données datent d’une semaine ou deux. Lui et Otto croient tous deux que les cas de variantes représentent environ 50 pour cent des infections actuelles dans la province.

Un article de pré-impression réalisé par les scientifiques du BC Center for Disease Control montre que les chiffres publiés publiquement des variantes préoccupantes sont inférieurs à ceux capturés par le test PCR.

Le document, récemment publié sur un serveur public avant l’examen formel par les pairs, indique que 23 cas de variantes présumées ont été identifiés par le test PCR la semaine du 31 janvier, ce qui représente un peu plus d’un pour cent des infections.

Pour la semaine du 28 février, il y a eu 434 cas de variantes présumées, soit 12,2% des infections, indique le journal.

Les auteurs de l’article ont conclu qu’il y avait une «concordance élevée» entre les tests PCR et le séquençage du génome entier, et qu’une approche de test combinée était faisable.

Le BC Center for Disease Control n’a pas immédiatement répondu aux demandes de commentaires.

Contrairement aux chiffres du journal, Henry et le ministre de la Santé Adrian Dix ont rapporté que la province n’avait vu que 14 variantes de cas à la fin de janvier, ce nombre passant à 158 à la fin de février.

Le 25 mars, Henry a déclaré que le pourcentage de cas de variantes se situait entre les «adolescents élevés» et le «début de la vingtaine».

Otto et von Bergmann ont tous deux déclaré qu’étant donné la croissance exponentielle des variantes préoccupantes, il est probable qu’elles représentent désormais environ la moitié des cas actifs.

Henry a déclaré mardi que la province dépistait environ 90% des tests positifs pour la mutation associée aux trois principales variantes préoccupantes. Tous les échantillons contenant la mutation subissent un séquençage du génome entier, a-t-elle déclaré.

Otto a déclaré qu’elle pensait que les remarques d’Henry étaient basées sur des informations obsolètes.

« Je sais qu’ils avaient l’intention de séquencer tout ce qui était apparu comme une variante. C’était possible quand il n’y avait que quelques cas ou quelques centaines de cas. Mais nous entrons dans la région où c’est quelques milliers de cas par semaine,  » dit-elle.

L’Ontario rend compte quotidiennement des cas de variantes identifiés par les tests PCR. Il est capable de détecter les cas impliquant B.1.1.7 en se basant uniquement sur le test, mais doit effectuer un séquençage du génome entier pour faire la distinction entre P.1 et B.1.351.

Henry a déclaré que le fait de rapporter des variantes préoccupantes sur la base du test PCR fournirait un chiffre « gonflé » parce que d’autres variantes contiennent également la mutation que les trois principales partagent.

Mais von Bergmann a noté que l’article du BC Center for Disease Control a montré qu’une des 23 variantes présumées préoccupantes identifiées par le test PCR s’est avérée être une non-variante préoccupante après le séquençage du génome entier.

En même temps, a-t-il souligné, un autre de ces 23 personnes ne pouvait pas subir de séquençage parce qu’il n’y avait pas assez de matériel génétique.

« Cela va dans les deux sens et nous donnons un décompte extrêmement dégonflé en ce moment. »