La menace d’une variante delta occupe une place importante dans le Sud non vacciné

Au Royaume-Uni, les enfants sont à l’origine de la flambée des cas delta, a déclaré mardi le Dr Anthony Fauci, directeur de l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses, lors d’un briefing à la Maison Blanche sur le Covid-19. La variante delta représente plus de 95% des cas au Royaume-Uni, a-t-il déclaré.

Des essais cliniques de vaccins pour les jeunes enfants sont en cours aux États-Unis, mais actuellement, seules les personnes de 12 ans et plus sont éligibles pour recevoir les vaccins. Bien que les enfants en bonne santé courent un risque beaucoup plus faible de maladie grave et de décès dus à Covid-19, ils peuvent propager le virus.

« Avec les enfants, le problème est la transmission aux autres », a déclaré le Dr Katherine Baumgarten, spécialiste des maladies infectieuses chez Ochsner Health à la Nouvelle-Orléans. « Il s’agit désormais d’une maladie évitable chez ceux qui peuvent se faire vacciner, il est donc important de continuer à étudier le vaccin chez les enfants. »

Delta de suivi

À Shreveport, Kamil et ses collègues séquencent régulièrement les génomes d’échantillons de virus de toute la Louisiane et de tout le pays, pour surveiller la mutation du coronavirus et suivre où et comment les différentes variantes se propagent.

Jusqu’à présent, 10 cas de la variante delta ont été identifiés en Louisiane, mais avec moins de 34 % des habitants de l’État entièrement vaccinés contre Covid-19 et seulement 29,5% des habitants de Shreveport, Kamil sait que ce nombre pourrait se multiplier rapidement.

« Tout ce qu’il faut, c’est une petite minorité de personnes qui ne sont pas vaccinées ou qui ont une immunité suffisamment faible pour permettre au virus de se propager et de maintenir la pandémie latente », a-t-il déclaré.

Kamil le sait car il l’a déjà vu, avec une variante différente connue sous le nom d’alpha qui a été identifiée pour la première fois au Royaume-Uni. La variante alpha, qui s’appelait auparavant B.1.1.7, est devenue la souche dominante aux États-Unis en avril, dépassant toutes les autres qui circulaient dans le pays.

Le laboratoire de Kamil à la Louisiana State University Health Shreveport a séquencé son premier échantillon de la variante alpha début avril. Maintenant, il estime que plus de 90 pour cent des échantillons que lui et ses collègues séquencent sont des cas alpha.

Ce que l’on sait du delta

Il existe plusieurs moyens par lesquels les scientifiques peuvent évaluer si une variante nouvellement identifiée est plus contagieuse, si elle provoque une maladie plus grave et quel type de réponse elle a aux vaccins existants. La première partie consiste à extraire des données épidémiologiques, qui peuvent révéler des informations sur la variante spécifique impliquée, la communauté dans laquelle elle se propageait, les symptômes que le patient a développés et si la personne a été vaccinée ou non.

Mais les chercheurs peuvent également explorer le génome séquencé du virus pour identifier des mutations spécifiques qui sont acquises au fur et à mesure que l’agent pathogène se réplique et évolue. Ces mutations aléatoires sont souvent sans conséquence, mais parfois, certaines rendront le virus plus capable de détourner les cellules humaines, le rendant ainsi plus contagieux, ou de changer ce que le virus peut faire après avoir envahi le corps, lui permettant potentiellement de provoquer une maladie plus grave.

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« Chaque mutation achète au virus un billet de loterie. Parfois, ce billet de loterie propose une mutation qui lui permet de se transmettre à plus de personnes », a déclaré Bill Hanage, professeur agrégé d’épidémiologie à la Harvard TH Chan School of Public Health.

Début juin, le secrétaire britannique à la Santé, Matt Hancock, a déclaré que la variante delta était considérée comme 40% plus transmissible que la variante alpha, bien que des études soient en cours à l’époque. Des recherches ultérieures de Public Health England ont suggéré que la variante delta est 60 pour cent plus transmissible dans les ménages, par rapport à la variante alpha.

« Au fur et à mesure que des variantes émergent, nous remarquons qu’il existe une différence de transmissibilité ainsi qu’un potentiel de résultats plus dangereux », a déclaré le Dr Alejandro Perez-Trepichio, interniste et médecin-chef du Millennium Physician Group, qui représente 550 médecins. dans 19 comtés de Floride. « Dans le cas de la variante delta, son taux de transmission a été estimé à 40 à 60 % plus élevé que la variante britannique précédente, ce qui était à son tour supérieur à celui d’origine. Nous assistons donc à cet effet multiplicateur.

Sur la base des données du Royaume-Uni, il y a des indications que les vaccins peuvent être légèrement moins efficaces contre la variante delta, par rapport à l’alpha et à d’autres qui ont été précédemment identifiés. Cela est particulièrement vrai pour les personnes qui n’ont reçu qu’une seule injection d’un régime à deux doses.

Mais comme ce fut le cas avec la variante alpha, les vaccins disponibles semblent offrir une bonne protection contre le delta chez les personnes complètement vaccinées. Une analyse publiée le 14 juin par Public Health England a révélé que deux doses du vaccin Pfizer-BioNTech étaient efficaces à 96 pour cent contre l’hospitalisation de la variante delta et que deux doses du vaccin AstraZeneca étaient efficaces à 92 pour cent.

« Cela augmente certainement les enjeux de la vaccination », a déclaré Kamil à propos des résultats.

Et si des infections percées – c’est-à-dire des infections chez des personnes entièrement vaccinées – se produisent, elles semblent être bénignes. « Vous avez pris quelque chose qui aurait été sérieux et l’avez transformé en quelque chose de gérable », a déclaré Hanage.

Alors que la variante delta continue de s’installer aux États-Unis, les épidémiologistes surveillent de près ce qui se passe dans les États du sud-est comme l’Alabama, la Floride et le Mississippi, en particulier dans les régions à faible taux de vaccination.

« C’est à peu près à la même époque l’année dernière que le Sud a commencé à nous démontrer que oui, cela peut se transmettre en été », a déclaré Hanage. « Ce sera très intéressant et très utile de voir ce qui se passe. »

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