Factbox: Ce que nous savons de la souche danoise du coronavirus du vison

COPENHAGUE (Reuters) – Le Danemark a découvert une nouvelle souche mutée du coronavirus provenant d’élevages de visons dans le nord du pays, qui, selon les autorités, pourrait échapper aux futurs vaccins COVID-19.

Pour empêcher la contagion humaine, le gouvernement a ordonné l’abattage de toute la population de visons de 17 millions au Danemark, l’un des plus grands producteurs de peaux de vison au monde.

Voici ce que l’on sait de la souche danoise :

QUELLES SONT LES SOUCHES DE MINK ET POURQUOI SONT-ELLES IMPORTANTES ?

Le Danemark a identifié cinq variantes du virus provenant du vison, mais une seule – connue sous le nom de groupe 5 – a montré une « sensibilité réduite » aux anticorps, selon le State Serum Institute (SSI) du Danemark, qui s’occupe des maladies infectieuses.

L’épidémiologiste d’État Kare Molbak a déclaré que le groupe 5 n’était pas plus dangereux que les autres souches ou plus infectieux.

Les clusters 2, 3 et 4 sont toujours à l’étude pour une sensibilité réduite, ce qui a déjà été exclu dans la variante du cluster 1.

Jusqu’où le virus muté s’est-il propagé ?

Le groupe 5 a été trouvé dans cinq élevages de visons du nord du Danemark et 12 cas ont été enregistrés chez l’homme dans la même région danoise en août et septembre, mais aucun n’a été enregistré depuis lors, selon SSI.

« Nous pouvons simplement espérer qu’il n’existe plus dans la même mesure », a déclaré Molbak lors d’une conférence de presse jeudi, ajoutant que rien ne pouvait être dit avec certitude.

Le groupe 5 représente environ 5% des souches trouvées dans le nord du Danemark, mais il n’est pas apparu en dehors du pays et on ne sait pas immédiatement pourquoi il est apparu au Danemark.

QUELLE EST L’IMPLICATION POUR LES VACCINS FUTURS ?

Il est trop tôt pour dire quel impact, le cas échéant, la mutation du groupe 5 pourrait avoir sur l’efficacité des vaccins potentiels, a déclaré vendredi Soumya Swaminathan, scientifique en chef de l’Organisation mondiale de la santé.

Mais les premières études de laboratoire de SSI montrent que la nouvelle souche avait des mutations sur sa soi-disant protéine de pointe, qui envahit et infecte les cellules saines.

Cela pourrait poser un problème aux futurs vaccins actuellement en cours de développement, car la plupart d’entre eux se concentrent sur la désactivation de la protéine de pointe.

Les données ont été partagées avec des homologues internationaux, notamment l’OMS et le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC), et les séquences du génome des souches de virus mutées ont été enregistrées dans l’Initiative mondiale sur le partage de toutes les données sur la grippe (GISAID).

SSI a déclaré qu’il continuerait à partager ses conclusions.

POURQUOI LE VIRUS SE PROPAGE-T-IL CHEZ LES VISON ?

Le vison semble être sensible au nouveau virus et « de bons réservoirs » pour le virus, a déclaré jeudi l’OMS. Des épidémies se sont produites dans des élevages de visons au Danemark, aux Pays-Bas, en Espagne et aux États-Unis.

Comme les visons sont gardés dans des cages proches les unes des autres, le virus peut se propager facilement.

POURQUOI LES HUMAINS ?

Le vison et l’homme ont un trait biologique similaire concernant une soi-disant enzyme ACE2 exprimée par les cellules des voies respiratoires, ce qui facilite l’infection du vison par un virus qui s’est adapté à l’homme, Allan Randrup Thomsen, virologue à Copenhague Université, a déclaré à Reuters.

Mike Ryan, le plus grand expert des urgences de l’OMS, a déclaré « il y a toujours le potentiel que cela revienne aux humains ».

« C’est une préoccupation car les espèces de mammifères comme le vison sont de très bons hôtes et le virus peut évoluer au sein de ces espèces, surtout s’ils sont en grand nombre étroitement regroupés », a-t-il déclaré.

On pense que le nouveau coronavirus est passé des animaux aux humains en Chine, peut-être via des chauves-souris ou un autre animal sur un marché alimentaire à Wuhan.

LES AUTRES BÉTAILS SONT-ILS À RISQUE ?

Le risque est beaucoup plus faible chez les autres animaux d’élevage, comme les porcs et la volaille, car les fermes ont mis en place une biosécurité « très stricte » pour empêcher les virus de franchir la barrière des espèces, a déclaré vendredi Ryan de l’OMS.

Les tests n’ont pas réussi à infecter les porcs, tandis que les bovins n’ont été infectés que « dans une très faible mesure », selon l’Administration vétérinaire et alimentaire danoise.

Il a déclaré qu’un échantillon prélevé sur le pied d’un goéland avait été testé positif pour le nouveau coronavirus, mais il n’y avait aucune preuve qu’il avait infecté des oiseaux.

LA MUTATION EST-ELLE UN INQUIET ?

Les mutations dans les virus se produisent tout le temps. Les virus survivent en s’adaptant à de nouveaux environnements et la plupart des mutations du coronavirus sont inoffensives.

Deux facteurs sont impliqués dans la mutation, a déclaré Molbak. Premièrement, le virus doit s’adapter à son nouvel hôte. Deuxièmement, lorsqu’un virus pénètre dans une nouvelle population, de nombreux anticorps sont créés dans la population, ce que l’on appelle communément l’immunité collective.

Le virus réagit en créant des soi-disant mutants d’échappement d’anticorps, qui tentent d’éviter les anticorps dans la communauté.

QUELS SONT LES AUTRES PAYS ET QUI FONT ?

L’OMS a déclaré qu’elle examinait la biosécurité autour des élevages de visons dans les pays du monde entier pour éviter de nouveaux «événements de débordement».

La découverte de la mutation ne devrait pas modifier ce que font les gouvernements et les autorités du monde entier pour contrôler la pandémie, a-t-il déclaré jeudi.

La Grande-Bretagne a déclaré vendredi qu’elle obligerait tous les voyageurs arrivant du pays nordique à s’isoler à leur arrivée à la suite de l’épidémie, mais elle ne les considérait pas comme un risque pour le pays.