Connecter avec succès les biobanques avec la biotechnologie et la pharmacie

De nombreuses sociétés biotechnologiques et pharmaceutiques dépendent d’intermédiaires commerciaux pour s’approvisionner en échantillons cliniques ; cependant, il peut s’agir d’un processus déconnecté, empêchant le transfert d’informations sur la provenance des échantillons biologiques. En conséquence, les scientifiques ont une image incomplète des échantillons avec lesquels ils travaillent, ce qui soulève des questions quant à savoir s’ils sont susceptibles d’être adaptés à l’usage auquel ils sont destinés.

Réseaux technologiques a récemment eu le plaisir de parler avec Robert Hewitt, fondateur et directeur de Biosample Hub, une plateforme unique conçue pour connecter les sociétés biotechnologiques et pharmaceutiques aux biobanques. Biosample Hub vise à aider les scientifiques à obtenir les échantillons dont ils ont besoin pour soutenir les tests et le développement de nouvelles thérapies, diagnostics et vaccins, tout en établissant et en maintenant des informations sur la provenance des échantillons biologiques. Nous avons interviewé Robert pour en savoir plus.

Laura Lansdowne (LL) : Que sont les échantillons biologiques, comment sont-ils utilisés et par qui sont-ils utilisés ?

Robert Hewitt (RH) : Les échantillons biologiques sont des échantillons biologiques qui peuvent provenir de tout être humain, animal, végétal ou autre être vivant. Dans ce contexte, nous parlons d’échantillons humains. Il peut s’agir de sang, de tissus solides, de salive, d’urine ou de toute autre sécrétion ou excrétion. Ils peuvent être utilisés pour le diagnostic ou s’ils sont excédentaires par rapport aux besoins, ils peuvent être utilisés pour la recherche.

LL: Quel est le processus standard pour fournir des échantillons biologiques aux chercheurs qui en ont besoin ?

HR : Le processus standard consiste pour une unité hospitalière appelée biobanque à assumer la responsabilité de la collecte, du traitement et du stockage des échantillons biologiques. Ces unités disposent d’un personnel travaillant selon des normes professionnelles, qui s’assure que les échantillons sont collectés avec le consentement éclairé du patient et sont traités et stockés selon des procédures opérationnelles standard strictes afin de maintenir la qualité et la fiabilité des échantillons. Ils remettent des échantillons aux chercheurs qui ont obtenu une approbation éthique pour le travail pour lequel ils souhaitent utiliser les échantillons.

LL : Quels sont les principaux défis liés à ce processus et quel rôle jouent les courtiers commerciaux ?

HR : Les défis liés à la gestion des biobanques sont nombreux. Un défi majeur est d’obtenir les fonds nécessaires pour leur permettre de fonctionner efficacement avec un personnel et un équipement adéquats. Les biobanques sont une infrastructure essentielle pour la recherche, mais elles nécessitent un financement d’entretien continu, et en général, une grande partie doit provenir de l’institution hôte où il existe de nombreux autres besoins de financement concurrents.

Un autre défi majeur consiste à mettre en relation les chercheurs ayant besoin d’échantillons avec la biobanque appropriée. Les chercheurs ont des besoins très spécifiques, et souvent trouver la bonne biobanque pour répondre à ces besoins, c’est comme chercher une aiguille dans une botte de foin ! Ce n’est souvent pas facile à faire pour les chercheurs associés aux centres médicaux universitaires et aux hôpitaux (institutions publiques) où les échantillons sont généralement collectés. C’est beaucoup plus difficile à faire pour les chercheurs travaillant dans les sociétés biotechnologiques et pharmaceutiques (institutions privées) et ces chercheurs ont besoin d’échantillons de patients pour tester et développer les médicaments, les diagnostics et les vaccins dont nous dépendons tous.

Les courtiers commerciaux jouent un rôle important en fournissant des échantillons aux scientifiques de l’industrie. Leur rôle est d’être un intermédiaire entre les hôpitaux et les biobanques où les échantillons sont initialement collectés, et le client industriel. Bien qu’ils effectuent un service nécessaire, il existe certaines façons dont cela peut ne pas être idéal. En général, les courtiers évitent de mettre le demandeur d’échantillon en contact direct avec la source de la biobanque, car cela risquerait d’être contourné pour de futures demandes et donc de perte de revenus. Ce manque de communication directe entre les biobanques et l’utilisateur final a tendance à empêcher le transfert d’informations sur la provenance des échantillons biologiques.

LL : Qu’est-ce que la provenance dans ce contexte et pourquoi est-elle si importante ?

HR : Le mot « provenance » signifie l’origine ou la source de quelque chose. Dans le monde médical et scientifique lorsqu’elle est appliquée aux échantillons biologiques, elle couvre les catégories d’informations suivantes :

• Exemple d’historique de traitement
• Informations sur le donneur et ses antécédents médicaux
• L’origine géographique des échantillons qui renseigne sur l’ethnicité et l’environnement
• Organisations antérieures qui ont eu la garde des échantillons

L’historique du traitement de l’échantillon permet au chercheur de déterminer si l’échantillon est susceptible d’être fiable pour la recherche envisagée. De nombreuses variables affectent la qualité de l’échantillon – par exemple, dans le cas des échantillons de sang qui nécessitent une centrifugation pour séparer les différents composants, la qualité de l’échantillon peut être affecté par le type de conteneur primaire utilisé, le délai de pré-centrifugation, les conditions de centrifugation (par exemple, la température, le temps et la force g) et plus encore. Tous ces détails doivent être suivis avec une attention méticuleuse si le chercheur veut être sûr que l’échantillon est fiable.

LL : Quels problèmes peuvent découler d’un manque de provenance ?

HR : Un exemple vient d’un programme majeur aux États-Unis appelé The Cancer Genome Atlas (TGCA), pour lequel des échantillons ont été demandés à des biobanques à travers le pays pour une analyse moléculaire. Un pourcentage très élevé d’échantillons reçus se sont avérés de si mauvaise qualité qu’ils étaient inutilisables, de sorte que les informations sur la provenance faisaient manifestement défaut ou n’étaient pas fiables. En 2018, la pathologiste de renom Carolyn Compton a écrit un article dans The Pathologist intitulé «Garbage In, Garbage Out: La raison cachée des résultats des tests de laboratoire peut ne pas être aussi fiable qu’il y paraît» et dans cet article, elle a souligné l’importance de contrôler les variables pré-analytiques qui affectent la qualité de l’échantillon.

Au cours des 10 dernières années, des améliorations majeures ont été apportées aux normes de biobanque, de nombreuses biobanques aux États-Unis, en Europe et dans le monde s’efforçant de s’améliorer. Certains ont introduit des programmes d’assurance qualité et obtenu l’accréditation et la certification selon diverses normes de qualité. Bien entendu, les normes varient d’une biobanque à l’autre et c’est pourquoi il est si important pour les chercheurs de connaître l’identité et la réputation de la biobanque d’où proviennent leurs échantillons.

Nos gènes et notre environnement affectent notre santé, les maladies que nous contractons et aussi notre réponse aux différents traitements. Il est donc important pour les chercheurs qui utilisent des échantillons biologiques dans leurs études d’avoir des informations sur des facteurs démographiques tels que l’âge, le sexe, l’origine ethnique et l’origine géographique.

LL : Que faut-il faire pour garantir que les échantillons biologiques soient toujours accompagnés d’informations fiables sur la provenance ?

HR : La première étape consiste à permettre une communication directe entre le chercheur de l’industrie et la biobanque source. Ce n’est qu’alors que le chercheur peut commencer à avoir confiance en l’information de provenance fournie. Pour obtenir une confiance totale, le chercheur voudra en savoir plus sur la biobanque, si elle a une forme de licence, de certification ou d’accréditation et les procédures opérationnelles standard qu’elle utilise.

À l’avenir, les autorités de régulation auront sans aucun doute un rôle clé. Par exemple, pour accéder au marché européen, les fabricants de dispositifs médicaux dont in vitro les diagnostics doivent maintenant démontrer que les échantillons biologiques utilisés pour valider leurs dispositifs ont subi un traitement pré-analytique acceptable. Ceci est requis en vertu du nouveau règlement européen IVD (IVDR) entrant en vigueur en mai 2022.

LL : Quelles sont les alternatives ? Par exemple, les chercheurs pourraient-ils construire leurs propres réseaux de fournisseurs ? Ou une bourse ou une chambre de compensation (telle qu’utilisée sur les marchés financiers) pourrait-elle résoudre le problème, c’est-à-dire que la chambre de compensation connaît les détails des fournisseurs et des utilisateurs et peut donner aux utilisateurs des informations pertinentes sur la base du besoin de savoir sans révéler les détails de la source ? Ou les chercheurs pourraient-ils être directement liés aux fournisseurs d’échantillons via une base de données centrale ?

HR : Une alternative consiste pour les chercheurs de l’industrie à obtenir des échantillons par l’intermédiaire d’un courtier qui permet une communication directe avec la source. Quelques courtiers de ce type existent et ils évitent le contournement par des accords contractuels avec leurs clients/partenaires. Le problème ici est que toutes les entreprises et les biobanques ne sont pas à l’aise avec des accords qui restreignent leur capacité à conclure différents partenariats à l’avenir.

Pour obtenir les échantillons dont elles ont besoin, les entreprises peuvent développer leurs propres réseaux de biobanques de manière indépendante, mais ce n’est pas un projet à court terme. Ils peuvent également accéder aux répertoires de biobanques accessibles au public, mais ceux-ci sont principalement conçus pour les chercheurs universitaires.

Une société à but non lucratif récemment créée, appelée Biosample Hub, fournit une solution supplémentaire, via une plate-forme en ligne dédiée au partenariat de l’industrie avec des biobanques universitaires. La plate-forme présente aux entreprises un réseau prêt à l’emploi de biobanques qui souhaitent toutes travailler avec l’industrie. La plateforme comprend également un annuaire des entreprises, un annuaire des demandes et des fonctionnalités de mise en réseau pour permettre aux membres de communiquer. Ceci est reçu positivement en Europe occidentale par les biobanques universitaires.

Robert Hewitt s’est entretenu avec Laura Elizabeth Lansdowne, rédactrice en chef de Technology Networks.